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第一部 ～神々に祝福されし青年～～プロローグ～
――この世界に、神なんていない
否、人間を喰らう神は……この世界そのものを奪い、侵食していく。
全てを奪い、喰らい、蹂躙するその存在は……人間達にとって、敵であり……畏怖する神のような存在だ。
いつしか人は、それをこう呼んだ。
――荒神（アラガミ）と
アラガミに対抗する為に生み出された「神を喰らいし者」――ゴッドイーター。
世界の救世主であり、同時にアラガミと同じような存在となった者達の、終わりなき戦いは続いている。
そんな中、今や世界の盟主となったアラガミ対抗組織「フェンリル」の支部の１つ「極東支部」にて、新たなゴッドイーターが生まれた。
この壊れた世界で生まれてしまった、壊れた人間。
後に、神に愛された兄妹と呼ばれることになるその青年は、この世界で何を思い生きていくのか。
これは、戦いの記録。
そして――絆と友情の物語。