２００４年 第５次聖杯戦争勃発・・・開始前日。冬木市の高校近くに住む一家が７歳の長男を残して惨殺され、少年は１人になった。
そして聖杯戦争決着・・・万能の願望機【聖杯】は破壊され終わった。
月日は流れ２０１７年 その破壊されたはずの聖杯が再び出現・・・そしてまた、戦いが始まる。
陰謀渦巻く冬木市、巻き込まれマスターとなった少年。その中で彼は生きるために、守るために、終わらせる為に戦う。
そして再び・・・彼らも動き出す。
時を経て、第６次聖杯戦争勃発。７騎サーヴァント、ルーラー、アヴェンジャー、計９騎のサーヴァントが集う・・・
～運命は、終わらない～
そして聖杯戦争決着・・・万能の願望機【聖杯】は破壊され終わった。
月日は流れ２０１７年 その破壊されたはずの聖杯が再び出現・・・そしてまた、戦いが始まる。
陰謀渦巻く冬木市、巻き込まれマスターとなった少年。その中で彼は生きるために、守るために、終わらせる為に戦う。
そして再び・・・彼らも動き出す。
時を経て、第６次聖杯戦争勃発。７騎サーヴァント、ルーラー、アヴェンジャー、計９騎のサーヴァントが集う・・・
～運命は、終わらない～