艦娘の存在しない鎮守府

深海棲艦に唯一対抗できる存在、艦娘。その艦娘が所属しない異例の鎮守府、薄暮鎮守府。ここには更に珍妙な指令がなされている。それは「他の鎮守府は、一定期間自らが保有する艦娘を薄暮鎮守府に出向させること、また、薄暮鎮守府はそれを拒まず、確実に受け入れる」こと。そんな鎮守府を舞台とし、一人の老いた提督を中心に艦娘たちとのストーリーが繰り広げられていく。